學(xué)校發(fā)端于陳嘉庚先生1918年以來在廈門集美學(xué)村創(chuàng)辦的系列專門學(xué)校。1994年10月，經(jīng)原**教育委員會(huì)批準(zhǔn)，原交通部所屬的集美航海學(xué)院、原農(nóng)業(yè)部所屬的廈門水產(chǎn)學(xué)院、福建省所屬的福建體育學(xué)院、集美財(cái)經(jīng)高等專科學(xué)校和廈門市所屬的集美師范高等?？茖W(xué)校等五所高等學(xué)校合并組建為集美大學(xué)。學(xué)校于1999年1月實(shí)現(xiàn)實(shí)質(zhì)性合并。2004年，廈門市工業(yè)學(xué)校成建制并入集美大學(xué)。2013年7月，國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)發(fā)文正式批準(zhǔn)集美大學(xué)為博士學(xué)位授予單位，船舶與海洋工程、水產(chǎn)等2個(gè)學(xué)科為博士學(xué)位授權(quán)一級(jí)學(xué)科。2018年，集美大學(xué)入選福建省“雙一流”建設(shè)高校。其中，該校入選高峰學(xué)科建設(shè)學(xué)科2個(gè)，高原學(xué)科建設(shè)學(xué)科4個(gè)。

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